Название "Река времени", в первую очередь, связано с речной спецификой района. В Нагатинском Затоне находился один из крупнейших судостроительных заводов, здесь был построен завершающий шлюз Канала им. Москвы. Большая часть жилых кварталов, природных и промышленных зон, о которых рассказывает экспозиция музея, расположена вдоль участка реки Москвы от Новоспасского монастыря до Капотни, а также вдоль малых рек, притоков и оврагов этих районов (Даниловка, Чура, Котловка, Жужа, Коршуниха и другие). Река стала образующей стихией районов Нагатино. "Река" в концепции музея понимается и как метафора течения времени. На стенах музея лента реки выполняет роль временной шкалы, вдоль которой располагаются артефакты разных эпох, начиная от Юрского периода и до современности. Среди них природные артефакты, фрагменты архитектуры, личные вещи, образцы различных производств, находившихся на территории Нагатино, аудио- и фотохроника, документы и тексты. Музей существует при поддержке сообщества краеведов и историков Южных округов Москвы. Экспонаты переданы из частных коллекций или подарены жителями районов. Коллекция музея постоянно пополняется. Одним из направлений деятельности музея станет поддержка краеведческих инициатив. На базе музея будут проводиться краеведческие встречи, кинопоказы и презентации, мастер-классы и экскурсии, встречи с местными жителями.