Музей Зеленограда был открыт в 1969 году по инициативе городской общественности — ветеранов войны и труда, а также краеведов, которые первыми стали собирать сведения и материалы о прошлом земли зеленоградской, о героических событиях 1941 года на подступах к Москве. Большая часть фондовых коллекций музея формировалась на основе дарения. Расположенный на территории Зеленоградского административного округа города Москвы, Музей Зеленограда изучает историю создания первого города-спутника столицы, который с 1962 года строился и развивался как Всесоюзный центр микроэлектроники. В 2022 году Музей Зеленограда был реорганизован путём присоединения в качестве отдела к ГБУК г. Москвы «Музейное объединение «Музей Москвы» и одновременно поменял свой адрес. Он переехал в одну из самых узнаваемых построек Зеленограда — дом Флейта, который является одним из образцов эпохи советского архитектурного модернизма. В планах музея освоение нового музейного и выставочного пространства в доме «Флейта», создание новых экспозиций. Традиционно в музее устраиваются встречи с интересными людьми, мастер-классы, концерты. В настоящее время в новом помещении музея открываются тематические выставки, которые знакомят с историей Зеленограда, его прошлым и настоящим, а также с историей здешних мест до строительства города-спутника Москвы.